La elevada densidad demográfica del país, especialmente en el área metropolitana de San Salvador, contribuye a incrementar los problemas ambientales urbanos, en particular la polución del aire y del agua. En las áreas urbanas, el 94% de la población tiene acceso al agua potable, pero en las áreas rurales sólo lo tiene el 70%. Sin embargo, el 62% del conjunto de los habitantes del país tiene acceso a instalaciones sanitarias. El Salvador sufre frecuentes terremotos destructivos y erupciones volcánicas. En 1998, el huracán Mitch causó importantes inundaciones y deslizamientos de tierra; en 2005, varios huracanes (Wilma, Stan…) provocaron también enormes desastres. Los terremotos de enero y febrero de 2001 causaron grandes pérdidas materiales, que se estimaron en unos dos mil millones de dólares estadounidenses.