En 1990, después de que se estimaran unas cifras de 900.000 personas fallecidas y de 1,3 millones de refugiados en el exterior, Chissano anunció su proyecto de establecer un gobierno multipartidista. El tratado de paz (conocido como Acuerdos de Roma) que ponía fin formalmente a la guerra civil se firmó en octubre de 1992; en diciembre se desplegó una fuerza pacificadora de la Organización de las Naciones Unidas (ONU), pero la escasa organización y una inadecuada financiación dificultaron su labor. Las elecciones multipartidistas, programadas para octubre de 1993, se celebraron en 1994. Afonso Dhlakama, líder del RENAMO, reconoció el triunfo de Chissano, que formó un gobierno encargado de cambiar la situación de uno de los países más pobres del mundo; con tal fin, en 1995 se presentó un plan quinquenal.

Por otro lado, el despliegue de cascos azules de la ONU permitió la desmovilización de 80.000 combatientes, la configuración de un Ejército nacional y el retorno a sus lugares de origen de casi dos millones de refugiados en otros países.

Miembro de la Commonwealth desde 1995, Mozambique se reveló como un notable exponente de consolidación democrática y recuperación económica del continente africano, reconocido por toda la comunidad internacional, a pesar del reajuste económico que ha sufrido y de sus elevadas cifras de pobreza.

Chissano venció de nuevo a Dhlakama en las elecciones presidenciales, así como su partido, el FRELIMO, hizo lo propio en las legislativas, celebradas respectivamente los días 3 y 4 de diciembre de 1999. El ciclón que azotó Mozambique en febrero de 2000 causó unos devastadores efectos que se sumaron a los de las lluvias torrenciales que desde el mes de enero venían cayendo sobre el país. Cerca de 200.000 personas permanecieron aisladas durante días en tejados o encaramadas en árboles esperando ser rescatadas por equipos que contaban con escasos medios, y miles de mozambiqueños fallecieron durante la catástrofe.

Joaquim Chissano

Chissano hizo un desesperado llamamiento a la comunidad internacional en demanda de ayuda. En diciembre de 2001, Chissano anunció que no optaría a un nuevo mandato en las elecciones presidenciales que habrían de tener lugar en diciembre de 2004. En esta cita con las urnas, la victoria fue para su sucesor en el liderazgo del FRELIMO, Armando Emílio Guebuza, el cual recibió el 63,7% de los votos (por el 31,7% de Dhlakama). Asimismo, el FRELIMO (que logró 160 escaños en la Asamblea) derrotó nuevamente al RENAMO (90) en los comicios parlamentarios celebrados de forma simultánea. El 2 de febrero de 2005, Guebuza sustituyó de forma oficial a Chissano en la presidencia del país. "Mozambique" Enciclopedia Microsoft® Encarta