Il territorio può essere diviso in tre regioni fisiche. I rilievi dell’Himalaya, ai confini con la Cina, che raggiungono un’altitudine media di oltre 4.500 m; le catene del Mahabharat e della Churia, dove si trovano elevazioni fino a 2.500 m di altitudine; la pianura del Terai, parte del bassopiano alluvionale del Gange, a tratti caratterizzata da una fitta vegetazione e interrotta da acquitrini e paludi. Un’altra zona pianeggiante è costituita dal bacino di Kathmandu, che si estende nell’area centrale del paese.

I rilievi sono incisi da strette valli in cui scorrono corsi d’acqua brevi e a regime torrentizio che confluiscono nel Gange; i tre fiumi principali che attraversano il paese sono il Karnali, il Kosi e il Narayani.