I rilievi, a est, declinano rapidamente verso una stretta pianura, che si estende lungo la costa dell’oceano Indiano, mentre a ovest digradano verso una fascia costiera pianeggiante un po’ più estesa, lungo il canale del Mozambico; in queste aree, oltre che nelle valli fluviali dell’altopiano centrale, si trovano le terre più fertili del paese.

I fiumi principali sono il Betsiboka, lo Tsiribihina, il Mangoky e l’Onilahy, che nascono dalla catena montuosa orientale e, scorrendo verso ovest e attraversando vallate ricche di vegetazione, sfociano nel canale di Mozambico. Al contrario, i fiumi che si dirigono verso l’oceano Indiano hanno corso breve e rapido, e, nella loro impetuosa discesa verso valle, danno frequentemente origine a delle cascate. Il lago più esteso del paese è l’Alaotra, nei pressi della città di Toamasina.